日本大学院的专业设置非常广泛，涵盖了人文科学、社会科学、自然科学、工程技术、商学与管理、医学、药学、齿学、农学、艺术学等多个领域。
以下是一些主要的专业类别及其下属的专业：
人文社会科学
文学：日本文学、中国文学、欧美文学等历史学：研究日本及世界历史的发展与变迁
哲学：探讨存在、知识、价值、理性、心灵等重要哲学问题
社会学：分析社会结构、文化、经济、政治等方面的社会现象
心理学：研究人类心理过程、行为和心智能力
教育学：培养未来教师以及教育领域的研究人员
自然科学
数学：纯数学、应用数学、统计学等领域物理学：探索物质的基本结构和宇宙的物理规律
化学：研究物质的组成、性质、变化及其规律
生物学：研究生命现象和生物体的结构与功能
地球科学：地质学、气象学、海洋学等多个子领域
工程技术
电子工程：电子技术、通信系统、计算机工程等机械工程：机械设计、制造、自动化等领域
土木工程：建筑设计、城市规划、环境工程等
材料科学：研究材料的性能、加工和应用
信息工程：计算机科学、信息技术和网络技术等
商学与管理
经济学：分析经济活动、市场机制和政策影响经营学：经营管理、经营战略、经营组织、市场营销等
会计学：会计实务、财务管理等
医学与药学
医学：基础医学、临床医学等药学：药物研究、药物制剂等
齿学：口腔医学、口腔保健等
农学
生物资源科学：农业生物学、农业环境科学等应用生命科学：农业生物技术、食品科学等
艺术设计
产品设计：工业产品设计、交互设计等空间设计：室内设计、环境设计等
服装设计：时装设计、纺织品设计等
音乐专业：作曲、声乐、器乐等
体育学
体育科学：运动生理学、运动心理学等保健体育：体育教育、健康促进等
新闻传媒
新闻学：新闻采访、新闻写作等传播学：媒体理论、媒体运营等
媒体学：媒体内容制作、媒体技术等
